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學(xué)術(shù)動(dòng)態(tài)

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研究快報(bào):首次應(yīng)用神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)分析解析微生物在污染物環(huán)境轉(zhuǎn)化過(guò)程中的作用

作者:李向偉

2024年3月,我院碳與環(huán)境修復(fù)團(tuán)隊(duì)在環(huán)境領(lǐng)域權(quán)威期刊《Science of the Total Environment》(中科院一區(qū) TOP)上發(fā)表最新研究成果:Neural network establishes co-occurrence links between transformation products of the contaminant and the soil microbiome,首次應(yīng)用神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)分析解析微生物在污染物環(huán)境轉(zhuǎn)化過(guò)程中的作用。我院碩士研究生向宇輝為論文第一作者,陳柯副教授為論文通訊作者。

殺蟲(chóng)劑、除草劑、抗生素、石化產(chǎn)品等人造化學(xué)物質(zhì)的使用在增強(qiáng)人類(lèi)生活質(zhì)量的同時(shí)也可能對(duì)生物和環(huán)境產(chǎn)生有害的影響。這些化學(xué)物質(zhì)在降解過(guò)程中產(chǎn)生的轉(zhuǎn)化產(chǎn)物(TPs)因可能對(duì)環(huán)境產(chǎn)生顯著的生態(tài)毒理效應(yīng),所以在近十年對(duì)轉(zhuǎn)化產(chǎn)物的研究引起了越來(lái)越多的關(guān)注。例如,多環(huán)芳烴(PAHs)在環(huán)境中普遍存在且濃度相對(duì)較高,對(duì)環(huán)境構(gòu)成了重大威脅。本研究提出了一種新策略,通過(guò)結(jié)合使用2H標(biāo)記的穩(wěn)定同位素輔助代謝組學(xué)(2H-SIAM)和基于神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的算法(即MMvec),來(lái)探索污染物(如芘)的TPs與土壤微生物群落之間的聯(lián)系。這種新策略建立的聯(lián)系已通過(guò)宏基因組研究、降解菌的鑒定和基于DNA的穩(wěn)定同位素探測(cè)研究等多種方法的驗(yàn)證,且其在建立聯(lián)系方面比其他方法表現(xiàn)更優(yōu)異。

圖2 TPs與微生物組之間的共生網(wǎng)絡(luò)

論文鏈接: https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2024.171287



編輯:陳柯   審核:劉子元、藍(lán)永麗   上傳:劉瑾   發(fā)布時(shí)間:2024-06-05