2025年4月8日，學(xué)院舉行“致知”論壇暨學(xué)術(shù)沙龍第十八講活動(dòng)。本次活動(dòng)邀請(qǐng)華中農(nóng)業(yè)大學(xué)的張樂(lè)博士對(duì)頂刊Science文章進(jìn)行題為“蛋白亞細(xì)胞定位的ProtGPS預(yù)測(cè)模型及其運(yùn)行部署”的解讀。本次活動(dòng)由覃永華副院長(zhǎng)主持，學(xué)院相關(guān)學(xué)科方向的教師及研究生參會(huì)聽(tīng)取報(bào)告并進(jìn)行學(xué)習(xí)。
張樂(lè)博士具備計(jì)算機(jī)本科與諾丁漢大學(xué)數(shù)據(jù)科學(xué)碩士背景，此次聚焦Science頂刊論文，深入闡釋蛋白亞細(xì)胞定位的ProtGPS預(yù)測(cè)模型。該模型借助先進(jìn)算法，整合多維度生物數(shù)據(jù)，精準(zhǔn)預(yù)測(cè)蛋白亞細(xì)胞定位，為解析蛋白功能、探究細(xì)胞生理機(jī)制筑牢基礎(chǔ)。同時(shí)，報(bào)告還講解模型運(yùn)行部署的技術(shù)要點(diǎn)，從代碼實(shí)現(xiàn)到環(huán)境配置，清晰呈現(xiàn)科研成果轉(zhuǎn)化為實(shí)用工具的路徑。
蛋白亞細(xì)胞定位研究本屬生命科學(xué)范疇，而ProtGPS模型依托數(shù)據(jù)科學(xué)、計(jì)算機(jī)算法實(shí)現(xiàn)突破，為跨學(xué)科融合能為傳統(tǒng)生物學(xué)難題提供創(chuàng)新解法，拓寬了師生對(duì)生物信息學(xué)研究邊界的認(rèn)知。在科研方法上，張樂(lè)對(duì)頂刊論文的拆解方式極具借鑒意義。從模型構(gòu)建邏輯、數(shù)據(jù)來(lái)源分析，到運(yùn)行部署實(shí)操，層層剖析，讓我們學(xué)會(huì)如何深度研讀高水平論文，提取核心思路與技術(shù)細(xì)節(jié)，助力自身科研思維提升。
問(wèn)答環(huán)節(jié)中有老師探討模型的可解釋性，疑問(wèn)“復(fù)雜算法構(gòu)建的模型，怎樣清晰闡釋定位預(yù)測(cè)的關(guān)鍵依據(jù)”。張樂(lè)表示，團(tuán)隊(duì)借助特征可視化、歸因分析等方法，挖掘?qū)︻A(yù)測(cè)結(jié)果影響顯著的蛋白序列模式與結(jié)構(gòu)特征，嘗試為模型預(yù)測(cè)邏輯“解密”，讓生物學(xué)意義更易理解。問(wèn)答環(huán)節(jié)的深度交流，讓ProtGPS模型從論文文本，走向?qū)嶋H應(yīng)用與學(xué)術(shù)探討的多維延展，助力師生深化對(duì)前沿生物信息學(xué)成果的認(rèn)知。
此次學(xué)術(shù)沙龍能夠啟發(fā)我們?cè)诳蒲泄ぷ髦袊L試跨學(xué)科的研究方法和技術(shù)手段，突破傳統(tǒng)研究的局限?？梢越梃bProtGPS模型的構(gòu)建思路，在自己的研究領(lǐng)域中開(kāi)展類(lèi)似的創(chuàng)新性研究，推動(dòng)學(xué)科交叉融合，產(chǎn)出更多高質(zhì)量的科研成果。
